Cơ quan Bảo vệ Môi trường Biển Sri Lanka (MEPA) cho biết họ đang đánh giá thiệt hại về môi trường và thu thập bằng chứng. Người ta đã lên kế hoạch khiếu nại sơ bộ.[39] Ô nhiễm hạt vi nhựa từ hàng hóa tràn ra các bãi biển của Sri Lanka từ ngày 27 tháng 5. Các viên nén LDPE cũng đã trôi dạt vào bờ biển gần đó.[14] Theo MEPA, trên tàu có ba thùng chứa hạt nhựa, mỗi thùng nặng 26.000 kg.[40]

Laurel Wamsley của NPR mô tả sự cố là một thảm họa môi trường vào tháng 6 năm 2021.[41]

Các chuyên gia y tế và Cơ quan Bảo vệ Môi trường cũng cảnh báo rằng có khả năng xảy ra mưa axit nhẹ ở Sri Lanka do phát thải nitơ dioxide.[42] Chính quyền Sri Lanka đã cấm đánh bắt ven biển từ Kalutara đến Negombo, vì lo ngại ô nhiễm. Trong một ngày, khoảng 5.600 tàu đánh cá không thể ra khơi và chính phủ hứa sẽ bồi thường.[43] Người dân cũng được Cơ quan Bảo vệ Môi trường biển khuyến cáo không chạm vào bất kỳ mảnh vỡ nào của tàu container nhiễm chất độc hại.[44][45]

MEPA cho biết họ đã bắt đầu thu thập bằng chứng để nộp đơn yêu cầu bồi thường tạm thời cho những thiệt hại về môi trường do con tàu gây ra. Một đơn khiếu nại của cảnh sát đã được thực hiện để điều tra sơ suất. Cảnh sát cũng đang tập hợp một hội đồng chuyên gia để đánh giá thiệt hại môi trường lâu dài hơn. Cá và rùa chết tiếp tục trôi dạt vào các bãi biển của Sri Lanka và đang được kiểm tra để xác định xem liệu nó có liên quan đến sự cố tràn dầu hay không.[12] Trong số 1486 container, 81 trong số đó được coi là vật chứa độc hại nguy hiểm bao gồm 5 tấn axit nitric.[46]

Vào tháng 6 năm 2021, có thông tin cho rằng con tàu container đã bị nhấn chìm xuống biển sẽ gây ra những ảnh hưởng xấu đến các loài sinh vật biển.[47] Vào ngày 2 tháng 6, các tàu cứu hộ đã thiết lập một đường dây kéo X-Press Pearl ra khỏi bờ biển khi phần đuôi tàu chạm đáy buộc họ phải hủy bỏ hoạt động. Thuyền trưởng Hải quân Sri Lanka Indika de Silva cho biết không rõ liệu có bất kỳ boongke nào chưa cháy còn lại trên tàu hay không nhưng các nhà chức trách đang theo dõi sự cố tràn dầu..[48]